西部中医药杂志

期刊简介

  《西部中医药》杂志原名《甘肃中医》(创刊于1988年),是经国家科委和国家新闻出版署批准由甘肃省卫生健康委员会主管,中华中医药学会、甘肃省中医药研究院主办的专业性学术期刊。以反映西部地区中医药研究、开发和应用成果,传播中医药信息与研究动态,继承发扬中医中药传统,促进中医药理论研究与学术交流为办刊宗旨。本着提高为主,提高与普及相结合的办刊方针,设有论著:理论论著、临床论著;方药:道地药材、方剂配伍、药理研究、质量分析、制剂工艺、本草新证;陇右医学:敦煌医学、岐黄医学、汉简医学、皇甫谧医学、伏羲文化、陇中骨伤;论坛:学术传承、博士论坛、医史文献、中医文化、教学研究、医疗管理、学术争鸣、杏林留芳、释古博今、医理溯源;专题:丝路医药、民族医药、灾害医学、流行病学、政策法规、调查分析、标准规范、域外汉方;报道:临证经验、衷中参西、特色医疗、临床护理、诊断剖析;动态:前沿探索、研究进展、品墨闻香、译林新意等栏目。读者对象是从事中西医药教学、科研、医疗、生产人员以及中医药院校的高年级学生等。

  《西部中医药》杂志先后入选“中国科技论文统计源期刊”(中国科技核心期刊)、中文生物医学期刊文献数据库——CMCC收录期刊、中国生物医学期刊引文数据库——CMCI收录期刊、中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊、中文科技期刊数据库(全文版)收录期刊、中国核心期刊(遴选)数据库收录期刊、中国期刊全文数据库全文收录期刊。杂志还先后获得“中国中医药优秀期刊”“甘肃省优秀期刊”称号。

  我刊将以“追求卓越,领先发展,争创一流”为发展目标,以“严谨、求实、团结协作、精益求精”为发展理念,为中医药科研、教学及临床工作者提供更好的服务。


癌症基因组学的三大统计陷阱

时间:2025-08-14 17:06:49

在生物医学研究中,癌症基因组学因其复杂的分子机制和高通量数据的爆炸性增长,成为统计陷阱的高发领域。从公共数据库(如TCGA、GEO)提取的基因表达数据,到临床转化研究中的靶向治疗响应分析,每一步都可能因方法学疏漏导致结论偏差。本文将聚焦三大核心问题:P值操纵的隐蔽性、可重复性危机的根源,以及方法学规范的关键作用。

P值操纵:从数据挖掘到选择性报告

在癌症基因组学中,P值常被误用为“显著性通行证”。例如,通过t检验比较肿瘤与正常组织的基因表达差异时,研究者可能对同一数据集进行多次检验(如上万次基因的差异分析),却未校正多重假设检验带来的假阳性率膨胀。这种“钓鱼式分析”类似于在黑暗森林中盲目射击——即使没有真实效应,也会有偶然命中的目标。更隐蔽的做法是选择性报告:仅展示P值显著的基因(如TP53、KRAS等高频突变基因),而忽略未达标的其他结果。这种操纵导致TCGA等数据库中部分“驱动基因”的结论难以在独立队列中复现。

可重复性危机:技术噪声与生物异质性的双重陷阱

基因表达数据的可重复性问题常源于技术层面与生物学层面的混淆。例如,RNA-Seq数据虽能检测低丰度转录本,但不同实验室的建库方法(如polyA富集与核糖体RNA去除)会导致同一基因的定量值差异高达20%。这就像用不同品牌的尺子测量同一物体——结果必然存在系统偏差。此外,肿瘤样本的异质性(如HRD阳性与阴性患者的PARPi响应差异)若未被预先分层,ANOVA分析可能掩盖亚群特异性效应。回归分析中忽略批次效应(如测序平台差异)更会放大虚假关联。

方法学规范:从预处理到模型选择的系统性方案

解决上述问题需建立全流程质控体系。数据预处理阶段,异常值剔除应结合生物学意义(如拷贝数变异导致的极端表达值),而非单纯依赖统计阈值。标准化方法需匹配数据类型:RNA-Seq适用TPM/RPKM消除测序深度影响,而芯片数据需RMA算法校正背景噪声。在统计建模时,针对癌症基因组学的“高维小样本”特性,建议采用弹性网络回归(结合L1/L2正则化)替代传统线性回归,以平衡特征选择与过拟合风险。临床转化研究中,HRD状态评估需同步报告检测方法(如Myriad MyChoice CDx与实验室自建方法的敏感性差异),避免技术偏倚误导治疗决策。

癌症基因组学的统计陷阱本质上是数据复杂度与人类认知局限的碰撞。通过强化方法透明度(如预注册分析计划)、采用鲁棒性算法(如非参数检验替代t检验),以及推动数据共享(如GEO的原始数据上传规范),方能将“陷阱”转化为推动精准医疗的基石。